Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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