Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms