Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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