Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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SH3BP4Q9P0V3 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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SH3BP4Q9P0V3 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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