Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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COL4A6Q14031 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
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COL4A6Q14031 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
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COL4A6Q14031 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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COL4A6Q14031 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
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COL4A6Q14031 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
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COL4A6Q14031 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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