Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CNGB1Q14028 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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