Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
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