Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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TOP3AQ13472 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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TOP3AQ13472 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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TOP3AQ13472 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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TOP3AQ13472 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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TOP3AQ13472 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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TOP3AQ13472 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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TOP3AQ13472 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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TOP3AQ13472 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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