Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms