Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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