Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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FOXF2Q12947 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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FOXF2Q12947 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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