Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms