Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
TTPAP49638 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
TTPAP49638 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTPAP49638 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTPAP49638 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTPAP49638 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTPAP49638 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTPAP49638 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTPAP49638 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTPAP49638 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTPAP49638 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTPAP49638 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTPAP49638 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTPAP49638 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTPAP49638 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTPAP49638 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTPAP49638 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTPAP49638 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTPAP49638 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms