Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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