Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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