Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN7O94888 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms