Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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SH3BP1Q9Y3L3 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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SH3BP1Q9Y3L3 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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SH3BP1Q9Y3L3 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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SH3BP1Q9Y3L3 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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SH3BP1Q9Y3L3 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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SH3BP1Q9Y3L3 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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SH3BP1Q9Y3L3 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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