Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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