Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.8 ms