Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX15Q9NRS6 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms