Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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USP29Q9HBJ7 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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USP29Q9HBJ7 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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USP29Q9HBJ7 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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USP29Q9HBJ7 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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USP29Q9HBJ7 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP29Q9HBJ7 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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