Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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