Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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