Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC025766.1-201ENST00000514061 409 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 MIR6732-201ENST00000619365 60 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC092646.1-201ENST00000427142 901 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 CSAG2-201ENST00000535353 237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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