Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CNGB1Q14028 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms