Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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