Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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