Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.8 ms