Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms