Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms