Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 DLG2-202ENST00000330014 2789 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms