Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA1Q9Y6Y1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms