Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms