Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms