Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms