Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Trem1Q9JKE2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Trem1Q9JKE2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Trem1Q9JKE2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Trem1Q9JKE2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trem1Q9JKE2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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