Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOPXQ9BPY8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms