Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 AC003986.3-201ENST00000417460 692 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 UCHL3-206ENST00000618773 1050 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 CU638689.4-208ENST00000623324 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 CU634019.6-203ENST00000624728 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 AP000944.1-201ENST00000533886 564 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms