Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms