Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms