Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.54■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.54■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.53■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.52■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms