Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZH9

Rasgrp3, RAS, guanyl-releasing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgrp3Q6NZH9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rasgrp3Q6NZH9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms