Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 DUXAP7-201ENST00000431038 689 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 H3F3A-203ENST00000366815 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 ZNF826P-202ENST00000542380 1067 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 AC020656.1-201ENST00000548900 599 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms