Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms