Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
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