Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
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