Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL4Q14135 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms