Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRSQ13332 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRSQ13332 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRSQ13332 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRSQ13332 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRSQ13332 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRSQ13332 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRSQ13332 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRSQ13332 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRSQ13332 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRSQ13332 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRSQ13332 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRSQ13332 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRSQ13332 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRSQ13332 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRSQ13332 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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PTPRSQ13332 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRSQ13332 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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PTPRSQ13332 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRSQ13332 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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PTPRSQ13332 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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PTPRSQ13332 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRSQ13332 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRSQ13332 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRSQ13332 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRSQ13332 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRSQ13332 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRSQ13332 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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