Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNDQ07001 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms