Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms